在《超迷你战士第六季：史前大冒险》中时间追溯到了原始时代，原始人正在遭遇各种各样的烦恼，而这些烦恼是被负能量所化的“烦恼精灵”造成的！发明超过500的女娃先知制造出了充满正能量的“超迷你战士”迷你勇和迷你萌，开始了以打败烦恼精灵为目标的史前大冒险！在冒险中他们不仅认识了强族先知和不那么平凡的原始人“阿焰”，还发现了烦恼精灵的惊天秘密，先知与超迷你战士是否能突破迷雾找到真相，打败烦恼，守护世界和平呢？
体力太差跑不动？老是忘东又忘西！原来人类的烦恼有可能不是自己造成的，而是烦恼星人制造的！还好，智商500的女娃博士用勇气与快乐能量创造出《超迷你战士》来帮助人类打败烦恼！虽然在大决战中暂时打退了可恶的烦恼星人，但是更强大的新烦恼星人又来了，据说他从不犯错，完美至极！与此同时，女娃博士更是面临了新挑战，有着一顶红头发，不可一世的地表最强小学生出现了！来势汹汹的他，到底是敌人还是朋友？面对不断涌现的烦恼与挑战，迷你勇和迷你萌迎难而上，一边努力进化自己，一边为人类不断战斗！有烦恼吗？快呼叫超迷你战士，打败你的烦恼！
山海妖星？时空裂缝？如何阻止妖族入侵拯救沧元界？
